Projekti i rizhvillimit u sponsorizua nga Spanjollët Cruz y Ortiz, ekspozita u hartua nga Jean-Michel Wilmotte dhe restaurimi u krye nga Van Hoogevest Architecten. Detyra e arkitektëve ishte të përshtateshin ndërtesën e rëndë në rrjedhën kryesore të eklekticizmit, e ndërtuar në 1885 nga Petrus (Pierre) Kuypers, për nevojat e një muzeu të shekullit 21. Brendësitë e harlisura tërhoqën vëmendjen nga ekspozitat, nuk kishte hapësirë të mjaftueshme për të dy ekspozitat dhe programin shoqërues, ishte e pamundur të rregullohej ekspozita e përhershme sipas një sistemi të vetëm, etj.
Tani të gjitha ekspozitat nga shekulli i 12-të deri në të 20-të janë rregulluar në një rend të rreptë kronologjik, sipas dyshemeve nga poshtë lart, dhe kronologjia mbështetet nga një skemë ngjyrash: bojërat në mure gradualisht ndriçohen ndërsa lëvizin lart, duke arritur pothuajse e bardhë në sallat e artit modern. Në të njëjtën kohë, të gjitha veprat u rregulluan në një mënyrë të re, me përjashtim të më të rëndësishmes - "Watch Night" nga Rembrandt, i cili u kthye në vendin e tij të dikurshëm në "Galerinë e Nderit", ku punimet e Artë Ekspozohen epoka e artit Hollandez.
Arkitektët, sipas skemës tashmë të vendosur në ndërtimin e muzeut, bllokuan dy oborre të ndërtesës me çati prej xhami dhe gjithashtu i thelluan ato në nivelin e katit -1, pasi kishin hequr më parë zgjatimet e mëvonshme që i zinin. Pastaj vendosën një auditor nën një oborr, dhe një dyqan muze dhe një kafene nën tjetrën. Vetë oborret janë kthyer në hapësira të gjera publike që mund të arrihen edhe pa blerë një biletë. Muret e tyre formojnë fasadat e oborrit të muzeut dhe sipërfaqet e reja përballen me gur me ngjyra të lehta. Antonio Cruz dhe Antonio Ortiz morën parasysh gabimin e Norman Foster, në oborrin e të cilit Muzeu Britanik çdo tingull dëgjohet qartë dhe madje bën jehonë, kështu që në Rijksmuseum, zhurmat mbyten nga grilat e bardha me material thithës të tingullit të pezulluar nga tavanet.
Por problemi kryesor për arkitektët ishte bashkimi i dy oborreve në një tërësi të vetme. Ndërtesa historike ka një korridor këmbësorësh dhe çiklistësh në qendër të fasadës, duke lejuar kalimin e shpejtë nëpër ndërtesë. Projekti i rindërtimit parashikonte ta kthente atë në hyrjen kryesore të muzeut, duke bashkuar të dy oborret, por banorët e qytetit u rebeluan dhe tani korridori është ruajtur në formën e tij origjinale, muzeu mund të arrihet përmes katër hyrjeve të vogla dhe u vendos një kalim nëntokësor nën të, duke lidhur oborret me njëri-tjetrin.
Muzeu u mbyll për rindërtim në 2003 dhe do të hapej tashmë në 2008. Periudha 10-vjeçare e punës shpjegohet me faktin se duheshin bërë përpjekje titanike për të ndërtuar nivele nëntokësore në tokën e mbushur me ujë të Amsterdamit dhe nuk kishte asnjë kontraktor për një projekt kaq kompleks. Inxhinierët e Arcadis bënë që pjesët e reja nëntokësore të ndërtesës të ishin strukturore të pavarura nga struktura historike, pasi ngadalë ulet. Prandaj, korridori tokësor dhe "Galeria e Nderit" e vendosur mbi kalimin nëntokësor midis oborreve janë kthyer tani në një "urë" të varur mbi të. Gropat e gërmuara u mbushën menjëherë me ujë, kështu që u derdhën me beton të veçantë për punë nën ujë, dhe procesi u kontrollua nga zhytësit.
Buxheti i projektit ishte 375 milion euro, por gjithashtu përfshin ndërtimin e një pavijoni të veçantë të artit aziatik, të vendosur në qendër të pellgut, përshtatjen e parkut në një kopsht skulpturash nga projekti Copijn Landschapsarchitecten (14,500 m2), ndërtimi i një ndërtese hyrëse shërbimi, rindërtimi i Shkollës historike të Vizatimit (Teekenschool) si një qendër arsimore muze, si dhe ndërtimi i një ndërtese të punëtorive muzeale pranë Rijksmuseum, u bashkuan me një tjetër ndërtesë të Kuypers - ish Instituti për Siguria dhe Shëndeti në Punë.
Por rinovimi i muzeut nuk ka përfunduar ende: ai mbeti i hapur për sa i përket rindërtimit
krahu Philips tani do të shndërrohet në një hapësirë moderne të ekspozitës së përkohshme. Autorët e projektit janë gjithashtu Cruz y Ortiz.
