Projekti filloi përsëri në 2001: në 1999, kontrolli mbi Kanalin e Panamasë u transferua nga Shtetet e Bashkuara tek autoritetet Panamane, dhe në të njëjtën kohë lindi pyetja në lidhje me përdorimin e ri të territoreve ngjitur. Një prej seksioneve - i zënë më parë nga baza ajrore amerikane - ishte caktuar për një muze. Ndërtimi filloi në 2006, por ishte vetëm në fillim të këtij Tetori që Biomuseo u hap për publikun - megjithëse jo akoma plotësisht: disa salla dhe një akuarium nuk do të jenë gati deri në dimrin 2016.
Me çatinë e tij shumëngjyrëshe prej alumini, muzeu duhet të kujtojë natyrën e gjallë të Panamasë, çatitë metalike të kasolleve lokale dhe strukturat historike të infrastrukturës së kanalit. E vendosur në një gadishull të ngushtë që del në gji, ndërtesa është e dukshme nga larg dhe vetë mund t'u ofrojë vizitorëve pamje panoramike të qytetit dhe "gojës" së Paqësorit të Kanalit të Panamasë.
Kohëzgjatja e ndërtimit të muzeut, me nofkën nga vendasit "muzeu që nuk do të përfundojë kurrë", shpjegohet, ndër të tjera, nga kualifikimet e ulëta të ndërtuesve vendas. Betoni i përafërt i dyshemeve dhe mureve duhej të derdhej shumë herë, dhe çatia me tolerancë prej 6 mm gjithashtu paraqiti shumë vështirësi.
Sidoqoftë, tani muzeu jo vetëm që është ndërtuar me sukses, por është pothuajse plotësisht i mbushur me ekspozitën "Ura e Jetës", e cila u hartua nga Bruce Mau. Institucioni Smithsonian në Uashington ishte përgjegjës për anën shkencore të projektit dhe Biomuseo u bë muzeu i tij partner i vetëm jashtë Shteteve të Bashkuara.
Muzeu i kushtohet larmisë natyrore të mahnitshme të Isthmusit të Panamasë: me një sipërfaqe prej 75,000 km2, ai është shtëpia e më shumë specieve të zogjve, gjitarëve, zvarranikëve dhe bimëve sesa në Shtetet e Bashkuara dhe Kanada së bashku. Përveç kësaj, ekspozita tregon në detaje për procesin e formimit të istmusit, i cili filloi 12 milion vjet më parë dhe përfundoi 3 milion vjet më parë. Pamja e saj ndryshoi ekosistemet dhe klimën në një shkallë planetare: në vend të një oqeani të vetëm, u ngrit një Atlantik dhe Paqësor shumë i ndryshëm, Rryma e Gjirit "filloi" nga deti Karaibe në zhvillim, dhe Amerika e Veriut dhe Jugut u bashkuan për herë të parë në 70 milion vjet Një migrim aktiv i kafshëve filloi përgjatë istmusit, dhe relativisht kohët e fundit, 15,000 vjet më parë, njerëzit e parë kaluan këtë rrugë nga veriu në jug.
Biomuseo, i cili kushton 95 milion dollarë (pa llogaritur kostot e sallave të ekspozitave ende të papërfunduara), është krijuar kryesisht për nxënës shkollorë (është planifikuar të sillni 40,000 studentë në vit atje për ekskursione falas) dhe për turistët, pasi terminali i anijeve turistike është shume afer. Në mënyrë ideale, autoritetet presin "efektin Bilbao" nga muzeu. Sipas planit të tyre, ai duhet të bëhet i njëjti simbol i qytetit të Panamasë dhe vendit të Panamasë, i cili Opera House e Utson u bë për Sidnein dhe Australinë.
