Ndërtesa është e vendosur në rrëzë të shkëmbit në të cilin ndodhet Akropoli. Për shkak të veçorive të sitit, ajo është e orientuar përgjatë boshtit lindje-perëndim, por duke zënë të gjithë katin e sipërm, të tretë, Galeria Parthenon është vendosur ashpër në lidhje me vëllimin kryesor të ndërtesës dhe shikon në veri. Kjo jo vetëm bëri të mundur zgjidhjen e pjesshme të problemit të mbinxehjes në klimat e nxehta, por gjithashtu lidhi vizualisht sallën me skulpturat që dikur zbukuronin fasadat e tempullit të madh, me vetë Parthenonin, që ndodhej më pak se 300 metra nga muzeu. Efekti dinamik i kësaj zgjidhjeje e mbush ndërtesën me energji; në këtë mund të shihet një kuptim i caktuar simbolik: duket se kthehet në Akropol, në të kaluarën, i cili korrespondon me mesazhin politik të vendosur nga qeveria Greke në ndërtesën e re: le ta kthejmë orën dhe ta rikthejmë monumentin në shteti origjinal (ose të paktën bashkoni të gjitha pjesët e tij tani të ruajtura në Londër, Paris, Palermo, Romë).
Një retorikë e tillë mund të ketë ndikuar në projektin arkitektonik: edhe pas fitores së versionit të Chumi në konkurs në 2001, kishte shumë mbështetës të dizajnit neoklasik të ndërtesës së muzeut në Greqi. Sidoqoftë, vëllimi shumë diskret i qelqit, betonit dhe mermerit ofron një sfond shumë më diskret për një koleksion skulpturash nga periudha Arkaike deri në kohën Romake sesa një lloj strukture "historizuese".
Për shkak të faktit se mbetjet e një lagje qyteti të kohërave antike u gjetën nën ndërtesë, u vendos që të ngrihej mbi tokë në 100 mbështetëse betoni me "mentesha", të cilat duhet të zbusin dridhjet në rast të një tërmeti të mundshëm; në shikim të parë, ato janë rregulluar rastësisht, por në realitet - në mënyrë që të mos dëmtojnë gjetjet arkeologjike. Themelet e shtëpive antike mund të shihen përmes hapjeve dhe hapësirave me xham në dyshemenë e katit përdhe të muzeut, ku ndodhen hollja dhe sallat e ekspozitave të përkohshme. Nga atje, vizitori ngjitet në katin e dytë, ku janë të ekspozuara të gjitha ekspozitat, përveç skulpturave të Parthenonit, dhe ka edhe një tarracë të hapur me një kafene. Kati i tretë me "Galerinë Parthenon" është një hapësirë me xham drejtkëndëshe, në qendër të së cilës ka një vëllim betoni, që përsërit madhësinë e cellit të tempullit. Frizi i famshëm me procesionin Panathenaic është rikrijuar në të nga pjesët origjinale dhe kastat.
Atmosfera serioze e "tempullit të artit" në muze do të vazhdojë pavarësisht nga numri i madh i vizitorëve që pritet: zhurma do të absorbohet nga vrimat e shumta rrethore të bëra në muret e betonit. Përveç mungesës së ndonjë dekori, numri i shenjave dhe etiketave është zvogëluar në minimumin e kërkuar: asgjë nuk duhet të tërheqë vëmendjen nga ekspozitat. Një rrugë e mirëmenduar do të lehtësojë inspektimin e koleksionit: nga gërmimet arkeologjike nën ndërtesë te skulptura arkaike në katin e dytë, pastaj te Galeria Parthenon në të tretin, dhe më pas te punimet e helenizmit dhe Periudhat romake.
