Historia e pasur arkitekturore e kompleksit filloi me përfundimin e ndërtesës së parë muze, të ndërtuar në 1939 nga Philip L. Goodwin dhe Edward Durell Stone, dhe menjëherë u bë e qartë se nuk kishte hapësirë të mjaftueshme. Philip Johnson ndërtoi dy ndërtesa shtesë për MOMA - në 1951 (tani e shkatërruar) dhe në 1964. Cesar Pelli shtoi hapësira ekspozite në kompleks, si dhe një kompleks banimi "Museum Tower" me 52 kate.
Taniguchi, i cili punoi në projektin e rindërtimit së bashku me zyrën e Kon Pedersen Fox, u përpoq të ruajë të gjitha gjurmët e ristrukturimit të mëparshëm, duke theksuar në to kënde të papritura.
Pavarësisht nga fakti që shekulli i 20-të ka mbaruar dhe për një kohë të gjatë arti më modern është ekspozuar në Muzeun Guggenheim, arkitekti nuk i dha ndërtesës një fokus intensiv në të ardhmen. Përkundrazi, lineariteti i theksuar dhe sipërfaqet e lëmuara të mureve përcjellin tërësinë e kësaj përvoje historike.
Lobi i ri me një fasadë prej xhami gri dhe granitit të zi paraprihet nga një ansambël ndërtesash të kohërave të ndryshme. Brenda, duke kaluar përgjatë një rreshti kolonash të bardha, vizitori hyn në një atrium të madh, rreth të cilit janë përqendruar galeritë e ekspozitave në të gjashtë katet. Urat e lehta në murin e largët të hollit lidhin sallat në nivele të ndryshme.
Punimet e mëvonshme janë të vendosura në nivelet e ulëta, klasike të hershme, të pakushtëzuara të artit të shekullit 20 - në krye.
Kur vizitori shikon nga niveli i sipërm i sallave, ai sheh mes dritës dhe, si të thuash, duke shpërndarë në arkitekturën e ajrit veprat më domethënëse të një periudhe të veçantë. Duke parë nëpër murin e xhamit të një prej fasadave të aneksit Taniguchi, Rodz's Balzac dhe makinat sportive italiane janë njëkohësisht të dukshme në galeritë e niveleve të ndryshme.
Një vend të veçantë në ansamblin e muzeut zë një kopsht me thupra të qara dhe ura mermeri, të vendosura pas murit të qelqtë të hollit. Ndodhet në tarraca të ulëta që i japin asaj një ndjesi të gjerë. Së bashku me ndërtesën e re gjashtëkatëshe, ndërtesat e vjetra, të cilat tani strehojnë një qendër arsimore, një bibliotekë filmi dhe një arkiv fotografish, gjithashtu hapen në kopsht.
